разведите эти события или научите как их развести внутри обработчика

Event {
  description = "Save panel directories on Exit";
  group = "ExitFAR";
  action = function(reload_macros)
    if not reload_macros then
      local p = {A=panel.GetPanelDirectory(nil,1),P=panel.GetPanelDirectory(nil,0),L=APanel.Left}
      mf.msave("setup", "ExitFAR", p)
    end
  end
}

Macro {
  description = "Restore panel directories on Start";
  area="Shell"; key="auto"; flags="RunAfterFARStart";
  action=function()
    local p = mf.mload("setup", "ExitFAR")
    if p and p.A then panel.SetPanelDirectory(nil,1,p.A) end
    if p and p.P then panel.SetPanelDirectory(nil,0,p.P) end
    if p and APanel.Left ~= p.L then Keys("CtrlU") end
  end
}